Accelerate liquid biopsy research and development with NGS-characterized matched FFPE and plasma sets.
Bridging a deep understanding of molecular profiles with clinical information is critical to developing innovative precision medicine tools in oncology. SpecimenSeq makes this challenge easier for targeted oncology developers by delivering access to fully consented, ethically collected FFPE & Plasma matched sets that are comprehensively annotated by genomic, phenotypic, and clinical characteristics.
Matched Biospecimen Sets, Same Donor Across Different Sample Formats
| BIOSPECIMEN FORMAT | QUANTITY | CHARACTERIZATION REPORTS |
|---|---|---|
| FFPE | 1 | • Clinical information and pathology report • Key variants report |
| Double Spun Plasma | 4 mL | • Clinical information and pathology report |
| Buffy Coat (optional) | -0.3 mL | • Clinical information and pathology report |
| DNA GENE CONTENT (64 GENES) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ABL1 | CDH1 | ER | FLT3 | IDH2 | MLH1 | PDGFRA | SMAD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| AKT1 | CDKN2A | ERBB2 | FOXL2 | JAK2 | MPL | PIK3CA | SMARCB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ALK | CSF1R | ERBB4 | GNA11 | JAK3 | MSH2 | PMS2 | SMO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| APC | CTLA4 | EZH2 | GNAQ | KDR | MSH6 | PR | SRC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ATM | CTNNB1 | FBXW7 | GNAS | KIT | MUM1 | PTEN | STK11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BCL6 | DDR2 | FGFR1 | HNF1A | KRAS | NOTCH1 | PTPN11 | TP53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRAF | DNMT3A | FGFR2 | HRAS | MAP2K1 | NPM1 | RB1 | TSC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CD10 | EGFR | FGFR3 | IDH1 | MET | NRAS | RET | VHL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RNA GENE FUSION CONTENT (6 PRIMARY GENES) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| EML4-ALK | MPRIP-NTRK1 | NCOA4-RET | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GCC2-ALK | SQSTM1-NTRK1 | TRIM33-RET | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HIP1-ALK | TPR-NTRK1 | CD74-ROS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KIF5B-ALK | TRIM24-NTRK2 | EZR-ROS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KLC1-ALK | ETV6-NTRK3 | GOPC-RPS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRN-ALK | SQSTM1-NTRK3 | LRIG3-ROS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TFG-ALK | CCDC6-RET | SDC4-ROS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TPR-ALK | CUX1-RET | SLC34A2-ROS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CD74-NTRK1 | KIAA1217-RET | TPM3-ROS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IRF2BP2-NTRK1 | KIF5B-RET | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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